故事基本上大致分為三段，從最一開始的Alisa加入團隊然後導致Lindo發生意外，接續到大家發現紫苑然後直到「神盾計畫」（事實上是「方舟計畫」），最後則是Lindo的復歸。 整個故事的進度與走向非常的順利且感人，唯有從《GOD EATER》銜接到《GOD EATER:BURST》故事時稍微有點冷掉了一些，但是後面銜接上以後，相信很多人應該跟冷日一樣又被感動了一次吧！ 故事一開始，本來對Alisa這個角色實在是感覺不太優，驕傲的性格卻沒啥實戰成績，更因為他的行動導致Lindo隊長發生意外，但後來再我們（就是玩家啦）漸漸解開Alisa心房並且瞭解了過去的悲慘經驗以及醫生的邪惡行為後，再加上Alisa的積極向上，Alisa這個角色變得令人挺無法不對他多些關注。 而Lindo和Sakuya的這段戀情，自始至終Sakuya的堅毅和Lindo那與玩世不恭態度不太搭調的溫柔也深深地刻印進我們心裡，再加上Lindo處處為隊友們著想的心意，也才會讓我們（無口的主角）喊出那唯一的一句對白，當聽到那句命令被喊出時，冷日真可謂『心頭一震』阿！ 紫苑這個「人型荒神少女」，純真到超越可愛的程度，可惜身為終末捕食的特異點，他的悲劇早在一開始就已經被決定了，同時也讓Soma這個和他最為接近的存在唯有背負著如天使羽毛般白色的神機不斷戰鬥下去的宿命（till my life comes to an end）！ 另外不得不提的就是Koda，身為「神盾計畫」的擁護者（因為想要守護，守護媽媽與妹妹）當他知道「神盾計畫」背後事實上是「方舟計畫」時，那段內心的掙扎也是本作中另一段高潮，最後媽媽的那段話（妹妹也說一樣的話，果然是母女）才讓Koda理解到親情之外的友情和大義也是很重要的存在。
最後當然就是我們所扮演的主角，剛毅、沉默、積極、守護隊友的性格，果然是整個故事的重心，從最一開始的菜鳥，後來居然守護並拯救了同為新型神機適格者的Alisa，進一步在失去Lindo後成為第一小隊的隊長（Lindo所在的第一小隊可是存活率90%以上的小隊，能替代Lindo這個隊長的位置，可見多受長官期待）帶領大家繼續生存下去，更協助協助紫苑以及Soma不斷地面對殘酷，最後更帶領第一小隊找回Lindo並且繼承Lindo的精神（不要死，不能放棄，活下去就有希望）把Lindo給帶了回來（也難怪Lindo會婉拒恢復第一小隊隊長之職，因為我們（主角）已經成功的繼承了他的意志）！ 這麼一路走來，冷日是完全的沉浸於這個角色之中，雖然無口、或許木訥、可能傻呼呼，但是說他是支撐著整個遠東分部的支柱也不為過阿！
首先是OP： GOD EATER OP 《Over the clouds》 演唱：alan 作詞：山本成美 作曲：菊池一仁 編曲：中野雄太
悲しみに濡れた月が靜かに | 浸染悲傷之月安靜地 大地を赤く赤く染めて消える | 將大地染成血紅沉寂 僕の聲が聞こえますか | 聽得到我的聲音嘛 殺伐としたこの時代で | 在這充滿殺戮的時代 僕は僕でいられますか | 自己能作為一個存在生存下來嘛 ココロ溢れ出す涙は | 心中溢出的眼淚 きっと未來を求めてる証なの | 定會成為追求未來的證明 今の無力を嘆かないで前を見つめて | 不必感慨今天的無力 只需凝視前方
You can get it over | 你可以超越它 over the clouds | 穿越云層之上
季節を移ろう風のざわめき | 風的萌動招致季節變換 終わりの見えない戦いへの序曲 | 無止盡戰斗的序曲才開始 人はなぜに忘れてくの | 人們為什么會忘記 ありきたりのこの日常に | 繁瑣普通的日常中 かけがえのないものがあると | 有著無法取代的東西 ボロボロになった羽根でも | 那遍布瘡痍的翅膀 誰かを想うその気持ちがあるなら | 有著那份對誰的思念 どんな苦しみに向かっても飛んで行けるさ | 就能展翅飛越任何痛苦 You can get it over | 你可以超越它 over the clouds | 穿越云層之巔
僕の聲が聞こえますか | 聽得到我的聲音嘛 殺伐としたこの時代で | 在這充滿殺戮的時代 僕は僕でいられますか | 自己能作為一個存在生存下來嘛 ココロ溢れ出す涙は | 心中溢出的眼淚 きっと未來を求めてる証なの | 定會成為追求未來的證明 ボロボロになった羽根でも | 那遍布瘡痍的翅膀 誰かを想うその気持ちがあるなら | 那遍布瘡痍的翅膀 どんな苦しみに向かっても飛んで行けるさ | 就能展翅飛越任何痛苦 You can get it over | 你可以超越它 over the clouds | 穿越云層之巔 You can get it over | 你可以超越它 over the clouds | 穿越云層之巔 ナガルルチシオハ イノチノヒカリ | 流淌的熱血 是生命之光 ヤミヨニトモルハ イノチノヒカリ | 點亮暗闇的 是生命之光
収録：『GOD EATERオリジナルサウンドトラック』発売日：2010/3/3
終わり
然後是ED： GOD EATER ED 《my life》 演唱：alan 作詞：古內東子 作曲：菊池一仁 編曲：中野雄太
終わらない歌がないなら<假如沒有永無休止的歌謠> くり返し歌えばいい<只需反復用心靈歌唱> 枯れない花がないなら<倘若沒有永不枯萎的花朵> 別のたね蒔けばいい<只需不斷播散新種> life...my life for you
Memories keep flooding in showing the paths I should've taken, but(記憶有如洪水一樣不停的湧現向我展示着我所應該走向道路，但是) now that time has run away from me I cannot change a thing.(現在時間已經離我以去，我己經無能為力了) I remember how you'd counsel me with wisdom of the ages true:(我記得你如何用歲月的智慧給我忠告：) "Live your best life" you told me and "You walk the earth but once"(「盡力的度過一生」你這樣告訴我 「你只能在地上走這麼的一次」) and now you've come, to see me once again,(而現在你來了，再一次來見我) I feel safe at last; Although I feel the end is coming closer unto me.(我終於感到安心；雖然我覺得盡頭離我越來越近我了) If I could only travel back in time, to peaceful days gone by.(如果我可以回到過去，回到已經逝去的和平日子) But this is my price to pay: to not survive beyond this very day.(但這就是我的代價：無法活過今天)
Oh, the pain is lessened when you're near, there is no fear.(啊，當你在身旁時痛苦沒那麼的難過，也沒有恐懼) I'm whole again as in days gone by, if only for a while.(隨着時間的過去我再次變得完整，就算只有一會兒) But it hurts to have to leave you so, I don't want to go.(但就這樣離開你使我傷感，我並不想離開) Could this sacrifice cost me my life?(難道這一次犧牲的代價是我的所有嗎？) Oh, just to live my life again, to treasure every little moment then,(啊，讓我再活一次我的一生，讓我去珍惜所有的每一刻，而後) satisfied, I'd leave you all behind, accepting of my fate.(當我滿足了之後，我會把你們放下，然後接受我的命運) But I am full of grief, to leave this life so incomplete.(但是就這樣離開這不完滿的一生，我感到充悲痛) My dream is coming to the end.(我的夢正步向完結)
And now the light is fading, broken wings have brought the journey's end.(現在光芒正在消失，破碎的翅膀帶來了旅途的終點) Your voice, that led me safe thus far is fading from my ears.(至今為止都讓我感到安心的你的聲音正從我的耳中消失) You were everything to me, a light to guide me in my darkest hour;(你是我的一切，你是在我最黑暗的時刻指引我的那道光芒) don't want to say goodbye just yet, don't want to be alone(還不想道別、不想獨自一人)
and then you come, to hold me once again, I feel safe at last.(然後你來了，再一次擁抱我，我終於感到安心) Although I feel the end is coming closer unto me.(雖然我覺得盡頭離我越來越近了) If I could only travel back in time, to peaceful days gone by.(如果我可以回到過去，回到已經逝去的和平日子) But this is my price to pay: to not survive beyond this very day.(但這就是我的代價：無法活過今天)
Oh, the pain is lessened when you're near, there is no fear.(啊，當你在身旁時痛苦沒那麼的難過，也沒有恐懼) I'm whole again as in days gone by, if only for a while.(隨着時間的過去我再次變得完整，就算只有一會兒) But it hurts to have to leave you so, I don't want to go.(但就這樣離開你使我傷感，我並不想離開) Could this sacrifice cost me my life?(難道這一次犧牲的代價是我的所有嗎？) Oh, tomorrow will not ever come, my night's begun.(啊，明天永遠不會到來，我的黑夜已經來臨) And I must travel far beyond, to places yet unseen.(而我必須啟程去遙遠的地方，去到從沒到過的地方) Remember me, and treasure everyday; even come what may(記得我，和珍惜每一天；甚至未來) forget not the precious gift of time, I pray.(都不忘記時間的珍貴禮物，我如此祈禱)
Oh, just to live my life again, to treasure every little moment then,(啊，讓我再活一次我的一生，讓我去珍惜所有的每一刻，而後) satisfied, I'd leave you all behind, accepting of my fate.(當我滿足了之後，我會把你們放下，然後接受我的命運) But I am full of grief, to leave this life so incomplete.(但是就這樣離開這不完滿的一生，我感到充悲痛) My dream is coming to the end.(我的夢正步向終結)
Fin
這三首歌個別出現在不同的片段，OP出現再遊戲的最前頭，略帶激勵的歌詞和小小地搖滾，讓人雖然感到些許的不安卻有勇往直前突破雲霄的勇氣！ 而ED則出現在《GOD EATER》的結局，中段紫苑就曾經哼唱這首歌（Soma教他低），在看到紫苑為了地球、為了人類所採取的舉動之後，搭配著這首離別哀傷的歌詞與鋼琴略顯寂寥的音樂，非常有催淚之效。 最後的插曲則是出現在《GOD EATER:BURST》的結局，事實上也是遊戲過程中曾經出現過，雖然《GOD EATER:BURST》不能算是Bad Ending，但是這首近乎絕望的歌倒像是在默默的控訴，人是無法成為神低『We just can fight till our life comes to the end』！
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